新生儿患心肌炎疾病时是不可以打疫苗的。

新生儿在出生之后，发现患有某种疾病需要及时治疗疾病，患有疾病之后不及时治疗，就会导致疾病加重。新生儿患心肌炎疾病之后，如果盲目的注射疫苗，会导致一些副作用的发生，这时不仅会导致患儿的心脏负荷加重，还会导致患儿出现发烧的现象。

新生儿患心肌炎疾病时应当规范的诊治，将这种疾病彻底治愈了，已经停用药物一周之后才能够注射疫苗，新生儿在出生之后要严格做好相关的防护措施，这样才能够防止疾病的发生。