头颅核磁是能查出脑血管堵塞的。

当临床怀疑头部腔隙性脑梗塞的时候，可以做一个头部的磁共振平扫，可以看到病变表现为T1加权等或者低信号，T2加权高信号，Flair序列表现为高信号的病变。当临床上考虑大脑中动脉、大脑前动脉，或者大脑后动脉有阻塞，可以做MRA，能看到上述血管的情况。如果有堵塞病灶的出现，也是一目了然的，很容易诊断。

当怀疑有静脉堵塞的时候，还可以做显示静脉的MRV检查。