沙眼的并发症有上睑下垂、睑内翻、倒睫、角膜血管翳、干眼症等。

如果出现这些并发症是需要针对这些情况具体的治疗，比如睑内翻患者，是需要进行睑内翻矫正术，不然睫毛长期摩擦角膜，结膜会引起局部的分泌物的增多以及流泪眼红等情况的发生，还有可能会造成视力的永久性的下降，干眼症患者平时在用眼过多或熬夜的情况下，眼睛干涩的情况会更加明显，除了局部热敷治疗，还可以考虑滴用人工泪液的滴眼液。

如果上睑下垂影响美容或视力，也是可以考虑手术治疗的。