抗精子抗体是男科实验室诊断免疫性不育的重要指标。正常生育男性，抗精子抗体为阴性。如果抗精子抗体阳性，就可能影响男子的生育。在男性抗精子抗体阳性时，其对精子有制动和细胞毒作用，从而阻碍精子与卵细胞的融合，甚至导致胚胎死亡和流产。

抗精子抗体可以在没有精子凝集的情况下存在，同样，凝集也可能有非精子抗体的其他因素引起。只有抗精子抗体存在是不足以诊断精子自身免疫的，必须证实抗体严重干扰精子功能，通过精子宫颈粘液穿透实验来证实。