非甾体的抗炎药主要通过肾脏排泄，所以有些长期口服非甾体类抗炎药的患者可以出现肾功能的损害。非甾体类抗炎药主要对肾小管产生损害。非甾体类抗炎药可以在肾小管内形成结晶，可以导致肾小管的堵塞，引起肾小管功能的异常。

此外非甾体类抗炎药还可以导致肾小管直接出现损伤，引起肾小管重吸收功能受到影响，引起肾小管的功能异常。有些非甾体类抗炎药甚至会引起变态反应性的损伤，导致肾小球基底膜出现损伤，患者可以表现为血尿蛋白尿。