严重败血症或毒血症患者可并发感染性休克、有高热、但也有体温不升、血压下降、四肢厥冷、多汗、口唇青紫。并发心肌炎时心动过速出现心律紊乱，如早搏、阵发性心动过速或心房纤颤。并发胸膜炎时，胸液为浆液纤维蛋白性渗出液。在青霉素应用以前还有并发脓胸的报道。

同时，肺炎球菌感染还会引起慢性支气管炎急性加剧，以及发生关节炎、结膜炎等疾病。随着抗生素的应用，近年来严重的并发症已经较少见。