宝宝嗓子化脓、反复发烧，可能有以下原因：

1.有可能与治疗不及时、治疗不正确、用药不合理有关系。宝宝嗓子化脓常见的疾病是急性化脓性扁桃体炎等相关的疾病，这种大多数与病毒细菌感染有直接关系。如果临床上治疗用药不合理、用药的剂量不够、疗程不够，或者病毒细菌的侵袭力过强，或者用药反复中断，出现耐药，可以导致这种感染一直控制不好。如果控制不好，就可以诱发患者出现全身感染，全身感染之后可以出现反复发烧的表现。

2.有可能与患者嗓子化脓之后累及到肺炎、气管炎等其他部位的疾病有关系。如果患者同时还伴有肺炎、支气管炎，或者同时伴有急性鼻窦炎等相关情况，由于炎症感染过于严重可以导致全身脓毒血症、败血症，可以导致宝宝反复出现发烧的表现。