药物流产之后三天，阴道里面肿了最常见的原因就是阴道局部的炎症，导致阴道黏膜组织充血、水肿，并且通常会伴有分泌物增多，阴道局部灼热感或者是不舒服症状的出现。

建议尽快去医院检查，了解究竟是哪一种致病菌导致的阴道内炎症性反应，通过高倍镜的白带化验能够明确诊断，然后针对性地用药进行治疗。并且也建议在药物流产之后一定要做到勤换卫生巾，保持外阴局部清洁，这样才能减少阴道局部出现炎症性反应。

另外，药物流产之后，在1个月之内是不可以有性生活。在药流之后，最好是7~10天去医院复查B超，了解宫内是否有残留的可能性。