月经干净后三天有透明白带的原因，可能属于正常的生理现象，也可能与一些疾病有关，具体要因人而异。

1.正常的生理现象。因为白带主要是由宫颈黏液以及阴道的一些渗液有关，宫颈黏液的变化会随着体内的雌孕激素水平而发生周期性改变，所以女性可能会在月经干净后三天出现分泌物有透明，是正常的情况。而且这时候女性除了分泌物略多、白带透明之外，没有任何的其他不适，这时候不必恐慌，正常进行日常的生活，避免寒凉，做好卫生护理就可以。

2.疾病的表现。对于一些女性来说，月经干净三天就有透明的白带，可能还伴随下腹的疼痛、阴道的瘙痒等症状。这时候要考虑是否发生了阴道的炎症、宫颈的炎症或者盆腔的炎症。建议女性到医院去查体，必要时做宫颈细胞学的检查和HPV的检测，以及妇科超声等明确诊断，需要医生来判断是否药物治疗。