妇科超声经腹部的超声和经阴道的超生是有一定的区别的。经阴道超声，又称为腔内超声。腔内超声是将超声的探头置于女性的阴道内，一般放置于宫颈和穹隆之间的部位。由于超声探头距离需要检查的部位子宫和双侧输卵管卵巢距离较近，因此，检查的准确性较高。对于已婚有性生活的女性，往往是采取经腔内的阴道超生来进行检查。

而经腹部的超声，主要是对于一些没有结婚的女性，要需要憋尿，使得膀胱充盈，造成一个升窗来进行对照。经腹部超声的缺点，是由于女性腹部有脂肪层，较厚的脂肪层会对超声造成衰减，因此，检查较阴道超声相对会准确性稍差一些。