自然流产分为早期流产和晚期流产。

在妊娠12周以内发生的自然流产，称为早期流产。导致早期流产的原因，大多数是由于胚胎本身的染色体异常所引起的，其它的原因有可能与感染的因素，尤其是b族溶血性链球菌的感染，另外有可能与免疫系统的疾病，比如系统性红斑狼疮、抗磷脂综合症的因素有关；晚期流产是指在妊娠12周以后，到妊娠28周之间发生的流产，晚期流产的原因大多数宇感染的因素免疫系统疾病或者是宫颈机能不全有关。

如果发生两次以上的自然流产，建议要进一步的查找原因，包括胚胎夫妻双方的染色体检测、免疫系统疾病的筛查、感染因素的检查以及宫颈管的长度的测定。