肛瘘可以打新冠疫苗，但肛瘘患者应该避开肛瘘急性发作期，进行新冠疫苗接种。

因为肛瘘急性发作期时，会导致局部出现红肿、疼痛，甚至出现发热。此时应该避免注射新冠疫苗，在感染控制后进入肛瘘发作间歇期时，再进行新冠疫苗接种。

另外，以下一些人群应该避免注射新冠疫苗，包括对疫苗过敏者，既往发生过疫苗严重过敏反应者，患有未控制的癫痫和其他严重神经系统疾病，正在发热或患急性疾病，或慢性疾病的急性发作期，或未控制的严重慢性病患者，妊娠期妇女，18周岁以下的人群。