妊娠期甲状腺功能亢进症的危害有：

1.在妊娠期间如果合并甲状腺功能亢进后，严格按照医嘱积极对症控制，一般危害性比较小，甚至没有危害。如果控制不了，有可能会导致孕妇出现流产、宫内感染、早产、胎盘早剥、高血压、心脏病等。

2.甲状腺功能亢进控制不好时，也会对胎儿有很大的影响。长期的高甲状腺激素水平，就可能会抑制胎儿甲状腺的生长和发育，从而引起胎儿出现甲状腺功能减退。

一旦确定妊娠合并甲状腺功能亢进症，需要严格按照医嘱进行调理，定期检查甲状腺功能。