支原体肺炎的并发症主要有支气管扩张、肺脓肿、肺囊肿、气胸，还有肺气肿以及闭塞性的支气管炎等等。如果症状严重，还有可能会出现呼吸衰竭以及心脏衰竭，还有急性呼吸窘迫综合征、弥散性血管内凝血等并发症。

支原体肺炎如果不能及时控制，还有可能会出现关节炎、脑膜炎、胃肠炎、神经根炎等等并发症。

支原体肺炎的并发症是全身性的，病人容易出现溶血性贫血，体温也会升高，且会出现不断咳嗽的症状，食欲相应的也会减退。还有可能引起心包炎、心肌炎或者肝炎等一些并发症。