深部脂肪瘤是否会引起疼痛，要根据脂肪瘤的大小、质地、部位，以及活动度等方面决定。

1.一般情况下，如果深部脂肪瘤体积较小、质地软，是不会有明显症状的也不会出现疼痛。

2.如果深部脂肪瘤体积比较大、质地硬、无活动度，压迫到了周围神经或者组织器官等，可能会出现疼痛以及相应部位的症状的。

3.如果深部脂肪瘤发生感染也会引起疼痛。

总之，通过彩超或CT等检查，来明确脂肪瘤的部位及大小等情况，尽量通过手术进行切除。