肛肠镜检查主要是检查肛门直肠肛管，主要是排除痔疮、肛裂、肛瘘、肛窦炎、肛乳头瘤、直肠炎、直肠癌、肛管癌、直肠粘膜内脱垂等疾病的检查方式。

一般患者取侧卧位或者胸膝位，将肛门镜插入肛门内部而达到检查的目的。检查前需要患者配合，同时需要用一些润滑剂防止将肛门撑破，造成肛裂的表现。

检查过程中患者会感觉到肛门坠胀、不适等症状，属于正常的情况，肛肠镜一般会检查7~10厘米左右。