膀胱灌注后的不良反应很多，例如膀胱灌注后，会引起膀胱局部处于充血状态，容易引起尿路刺激征，导致人出现尿频，和尿血现象。如果此时患有泌尿系统感染，则会加重泌尿系统感染病情。

另外，膀胱灌注后还会引起人出现全身不良反应，因为这类药物会刺激肠胃，导致人出现恶心、呕吐。

其次，膀胱灌注还会杀灭身体粒细胞，容易诱发脱发。

鉴于膀胱灌注后的不良反应较多，所以膀胱灌注需要按医嘱进行。同时观察不良反应的严重程度，严重时应前往医院进行治疗。