月经结束后还腹痛，原因可能有以下几种：

1.最常见的原因多是子宫内膜炎引起。由于经期使用了不干净的卫生巾，或者经期过于劳累导致抵抗力低下，会引起致病菌逆行感染导致子宫内膜炎发生，或者原有的病情加重，就会在经期结束后还有腹痛现象产生。同时伴有白带腥臭、肛门坠胀感等，需要及时予以抗炎治疗。

2.子宫肌瘤也会导致经期结束后还有腹痛症状存在，主要是肌瘤会影响子宫正常收缩，进而造成小腹疼痛，有时还会伴有月经期延长等。

3.其他系统疾病引起。比如泌尿系感染、慢性肠炎等，需要针对具体病因予以治疗。