隐睾症的发病原因与睾丸本身发育异常、参与睾丸下降过程的韧带、肌肉的发育异常，以及人体激素分泌器官的功能异常等因素有关。

睾丸随着人的生长发育逐渐下降到阴囊内，是一个很复杂的过程。绝大部分男孩在出生前睾丸就已经下降到阴囊内，最晚的在1周岁以前都会下降至阴囊内。如在1周岁以后睾丸还未降至阴囊内，即为隐睾症。睾丸的下降过程是由于睾丸引带的牵拉，及睾丸自身的下降动力共同完成的，这两者是缺一不可的。所以如果基因遗传因素导致睾丸引带缺失，则睾丸就失去向阴囊的牵引力，容易导致隐睾症的发生。而睾丸自身的动力与体内的相关激素水平有关，如患者有下丘脑垂体等分泌功能异常，则会导致这些激素水平的异常，从而使睾丸的自身动力减弱，甚至丧失。

所以在婴幼儿出生后应密切观察，便于尽可能早地发现隐睾症。尽早予以手术治疗，避免因为隐睾症导致睾丸发育异常。