人体肠道内很多细菌都可以引起结肠炎，其中最常见的是大肠杆菌、沙门菌群以及志贺菌群也是经常引起肠炎。

根据病因的不同，结肠炎可以分为感染性肠炎、炎性肠炎以及其他一些特殊类型的肠炎。人体肠道内存有大量的细菌，这些细菌大多属于机会致病性细菌，在人体处于健康状态时，不会引起感染，当免疫力低下或者肠黏膜损伤时，便可引起结肠炎。最常见的是大肠杆菌，但通常症状较轻，部分患者会出现慢性肠炎。

而感染性肠炎通常是由于饮食不洁导致的，致病菌通常为沙门氏菌或者是志贺菌群。