肾盂输尿管连接部梗阻可有狭窄和异物梗阻。

狭窄的患者可分为先天性和后天性的，先天性狭窄症状较轻的可保守治疗，观察等待，较重的引起肾积水较多可行肾盂成型手术治疗。后天性狭窄多为输尿管结石时间较长导致周围炎症浸润及息肉增生，治疗时可留置双J管扩张、肾盂成形术、球囊扩张手术等。

异物梗阻可由肿瘤、结石等引起，治疗方案主要为治疗原发病灶，输尿管肿瘤需行患侧肾、输尿管、膀胱部分切除术。结石可行输尿管软镜、经皮肾镜手术治疗。