引起排尿的时候尿道刺痛的原因很多：

首先，最常见的急性尿道炎，是引起尿道刺痛的常见疾病。因为急性尿道炎会引起尿道极度水肿、充血，这时排尿时就会导致尿道刺痛，同时会伴随着尿道瘙痒感与尿道灼热感。

其次，当尿道受到外力损伤后，会引起尿道黏膜溃疡、破损，排尿时也会引起尿道刺痛，通常会伴随明显尿道异物感。

最后，尿道结石也容易导致尿道刺痛。部分人群会在尿液中发现细小结石。

建议完善尿路系统超声检查和尿常规检查，明确具体病因。