导致慢性咽炎发病的原因，主要有局部因素和全身因素两大类。

首先，局部的因素通常指的是患者，经常反复出现急性咽炎、急性扁桃体炎或者是鼻炎等各种疾病。上述疾病对于咽喉黏膜以及黏膜下组织都有不良的影响，可能会诱导咽喉黏膜以及黏膜下组织出现慢性的功能异常。

其次，全身性的因素。主要是指身体内分泌功能紊乱、免疫力低下或者是由于营养不良等，造成维生素缺乏等情况。所以患有慢性咽炎的患者，除了要针对咽喉部位的炎症感染进行治疗以外，还要进行全身性的调理。