小腿骨折手术后疼痛可能是由于软组织损伤引起。

因为在手术时需要将局部的软组织切开，然后对骨折两端进行固定。在此过程当中，可能会使软组织受到过度牵拉和损伤，就会导致在术后出现疼痛肿胀等不适症状。而肿胀后可能会刺激到痛觉神经，也会导致疼痛加重。

此外，在手术时还有可能会对骨折端的骨膜造成损伤，而骨膜当中含有丰富的痛觉细胞，也会引起剧烈的疼痛。因此在小腿骨折手术后出现疼痛是一种正常的现象，疼痛的症状通常在1~2周后会逐渐消失。