目前关于面肌痉挛的病因认为较为复杂。

有如下几个因素

一是血管因素多数学者认为目前有80%到90%的面肌痉挛，是由于面神经出脑干区域存在血管压迫所导致的。其中，以小脑前下动脉以及小脑后下动脉为主，使得血管压迫到面神经而引起面肌痉挛的发作。

其他的非血管因素，包括脑桥小脑角的非血管占位性病变，比如说肉芽肿，肿瘤和囊肿等因素可以导致面肌痉挛。占位导致正常的血管移位，占位对面神经的直接压迫或者是占位本身异常血管的影响，比如说动静脉畸形,脑膜瘤、动脉瘤等压迫到面神经而引起。面肌痉挛的发作。其他的原因认为一些全身性的疾病，比如说多发性的硬化可能与面肌痉挛的发作有关系。