耳真菌病是可以选用微波方式进行治疗。

耳部的微波治疗可以通过微波的穿透性以及热效应，促进耳道内炎症感染的消退，促进耳部毛细血管的血流增速，改善耳部的供血和微循环，可以有效地帮助耳道组织内由真菌感染引起的炎症有效地好转。同时微波治疗还可以促进耳道组织内的细胞的自行恢复，也有利于受损的耳部黏膜的好转。

但是，单纯的通过微波治疗的方式，并不一定能够实现耳真菌病的痊愈。耳真菌病的治疗，通常还需要配合使用抗真菌类型的药物治疗。