小孩子反复发烧39℃，可能是感染因素和非感染因素引起。

感染因素多是由于受到细菌、病毒、支原体感染，这些病原菌会激发小孩的免疫系统，从而引起发烧。多见于病毒性感冒、细菌性感冒、消化道感染、呼吸系统感染等疾病引起，出现反复发烧。如果不根据病原菌进行抗炎治疗，会出现反复高烧不退。

非感染性的因素有可能是川崎病、免疫方面的疾病等原因引起。

所以小孩出现反复发烧39℃一定要查找原因，综合分析，然后对症治疗原发疾病。