肺部真菌主要是由于肺部被念珠菌、曲霉菌、卡氏肺孢子菌等等真菌感染以后形成的疾病，由于肺部真菌也是属于感染类的疾病，具有感染型疾病的共同特性，比如咳嗽、咳痰、发热等表现，但是不同的真菌感染又有不同的特点。

例如念珠菌感染肺部以后，痰液主要是白色粘稠拉丝痰，而曲霉菌感染肺部以后痰液为褐色或者是鲜红色，往往会伴有咯血，而肺孢子菌感染肺部后大部分为干咳无痰，很快会进展为咳嗽伴有呼吸困难和发热，严重的可以引起呼吸衰竭而导致死亡，因此不同的肺部真菌感染症状是不一样的，也有助于临床进行鉴别。