3岁宝宝积食肚子疼，可以采用以下方法进行处理：

1.宝宝积食肚子疼痛，可以给宝宝适当按摩和热敷腹部，促进肠道的蠕动，从而缓解积食腹胀、腹痛等不适症状。同时让宝宝多喝水，以清淡的食物为主，如小米粥、烂面条等，减轻肠道的负担。

2.宝宝肚子疼是积食导致，所以需要针对积食进行治疗。可以给宝宝服用化积的药物进行缓解，如婴儿健脾散、小儿七星茶、保和丸、小儿健脾颗粒，这些都可以起到健胃消积的作用，积食治好以后肚子疼的症状自然就会消失。