肛门里面长了软疙瘩，首先考虑是否存在痔疮病变，特别是内痔病变患者。

由于肛管静脉丛扩张以及肛垫下移，从而导致痔疮病变出现。病史较长的内痔患者可形成痔核组织，表现为肛门内部肉疙瘩，同时，可能出现便血的临床表现。特别是在大便干燥时，粪便损伤痔疮组织，从而出现便血症状。

其次，考虑是否存在息肉病变，例如直肠、肛管息肉，都可能表现为肛门内部肉疙瘩病变。早期症状不明显，随着息肉不断变大，可能出现便血，出现大便形状改变等情况。

确诊病情后，建议及早手术，将息肉组织切除，从而治愈病变。