单侧舌咽神经损伤可通过针对病因治疗，并加用促进神经功能恢复的药物治疗比较好。

导致舌咽神经损伤的原因有很多，比如手术误伤、骨折、肿瘤压迫、核性损伤等，只有去除病因才是保证舌咽神经功能恢复的基础，因此需要针对病因进行治疗。

在治疗期间患者还需服用营养神经的药物，比如维生素B1、维生素B12、脑蛋白水解物、神经生长因子等，有助于促进神经功能的恢复。另外，患者还需要尽早进行康复训练，越早进行训练，恢复效果越好。