小儿肛裂发生的病因，主要有以下几种情况：

1.肛门周围肌肉组织发育不完善，小儿体质较弱，可以使肛门周围皮肤脆性变强，进而会有肛裂的发生。

2.小儿存在便秘的情况。由于大便过于干硬，在排出的时候难以排出，过度用力，并且干硬的粪便可以摩擦刺激，肛管直肠位置的皮肤和黏膜形成裂口。

3.由于小儿反复的腹泻。有一部分小儿由于饮食不洁等因素，导致长期的腹泻，可以使肛门位置的皮肤和黏膜组织的脆性增强，并且会形成溃疡，溃疡进一步加深就会形成皮肤以及黏膜组织的裂口。