在怀孕期做羊水穿刺手术，确实有可能会导致流产的发生。但是发生流产的几率非常小，做羊水穿刺检查之后发生流产的几率大约是5‰。

这个几率相对于胎儿不正常在生出来宝宝之后才发现宝宝有问题，而存在宝宝不能生存或者生存质量太差的情况相比较，也是该接受风险的情况就必须接受的。也就是大多数的人群接受羊水穿刺检查，并不会因此而导致后遗的问题发生。

所以会建议有高危因素的人群，比如孕妇的年龄太大，或者是唐氏筛查检查到高危的情况，都要做检查。