女性衣原体的检查为阴性的意思是，没有感染衣原体的疾病。女性最常见的检查就是女性沙眼衣原体的检测。取女性的阴道内的分泌物通过PCR的技术来进行检测，该检测方法特异性很高，可以快速的出结果。

沙眼衣原体的感染是常见的性传播的疾病，可以引起女性白带的异常，甚至还可以引起子宫颈炎症、子宫内膜的炎症、输卵管的炎症、腹膜的炎症等等，从而它会引起继发性不孕症的发生。

孕期的妇女，如果感染了衣原体可能会对胎儿引起流产、早产等等。所以在妇科的检查中一般都会常规的行衣原体的检查，排除衣原体的感染等等。