肛管直肠恶性黑色素瘤，是来源于黑色素细胞的恶性疾病。在胚胎发育过程中，黑色素细胞迁移到皮肤也粘膜表面和神经系统部位，在某些因素的影响下，比如激素代谢水平失调、化学炎性的刺激以及局部高能辐射的损伤，会使黑色素细胞过度增生而产生恶变。

肛管直肠交界部属于复层鳞状上皮，此处聚集着大量的黑色素细胞，这是肛管直肠恶性黑色素瘤发生的组织学基础。肛管直肠黑色素瘤的恶性程度非常高，预后很差，所以患者应及时去医院就诊治疗。