直肠炎的病因有很多，比如说慢性炎症刺激、慢性非特异性结肠炎和慢性细菌感染时，粘膜常受炎症刺激或发生肉芽肿。

此外，直肠非常脆弱，如果受到一些异物刺激，如未消化的木屑、硬食物残渣、角状食物等。会对黏膜造成损伤，从而诱发直肠炎。大便干燥的人，因为大便太硬而粘膜受损，最终诱发直肠炎。

此外，当患上慢性炎症性感染时，如慢性细菌感染、慢性非特异性结肠炎等疾病会持续刺激黏膜，导致炎症病变。此外，炎症也可由肛瘘和痔疮的影响引起。