肛周脓肿在未完全恢复前，会持续有疼痛感。

肛周脓肿在发病早期，肛周会出现一个疼痛性的炎性包块，这时疼痛感比较轻，患者可以忍受。但如果未进行有效的治疗，感染会逐渐加重，肿块疼痛越来越严重。

在感染成脓时疼痛感会达到峰值，患者感肛周剧烈胀痛，而且影响大小便。当脓肿破溃或行手术治疗后，疼痛感就会逐渐减轻。因为脓液已经被完全引流出来，脓腔内的压力降低所以胀痛会减轻，当脓肿完全治愈后，疼痛会消失。