纵隔囊肿可以进行初步的筛查，可行胸部X光的检查，能够早期发现肿瘤囊肿。纵隔当中会对纵隔部位的器官造成压迫，如果患者有吞咽困难，需要进行食管钡餐造影的检查。

纵隔囊肿需要做纵隔CT的检查，通过CT可以发现纵隔发生囊肿的部位、纵隔囊肿的大小，以及纵隔囊肿对周围器官的压迫情况。

纵隔囊肿还可以进行磁共振的检查，磁共振可以更加清晰的显示囊肿的部位。手术切除囊肿后，要常规的进行病理的检查，明确囊肿的病理类型，根据囊肿的病理类型，再决定下一步的治疗。