肛门失禁治疗上较困难，发病原因是多方面的，肛门失禁会因疾病的严重程度而出现不同的症状。

对应的治疗措施也不同虽然治疗肛门失禁的方法有很多，但目前尚未有一种能长期有效并且并发症较少的治疗措施。肛门失禁的最初治疗以保守治疗为主，主要在饮食，药物及心理方面改善肛门失禁的症状及生活质量。如果经保守治疗后，肛门失禁未出现明显好转，可考虑进一步手术治疗。

手术方案主要有两种：肛门括约肌缺损的直接修复或肛门括约肌增强。对于某些严重的肛门事件患者粪便改道，是肛门失禁治疗失败后有效，安全且合适的手术治疗措施，结肠造口术或回肠造口术应用于多种原因诱发的肛门失禁。