头顶一晃就很痛的原因如下：

1.颈椎病。本病主要是由于颈椎不稳或退行性病变所引起，发病的时候如果颈椎大范围活动，导致脑供血不足从而出现头晕、头痛的症状。

2.和颅内压增高有关。当血压突然之间增高导致脑水肿、颅内压增高的时候，出现头一晃就疼的症状。

3.青光眼。本病发病的时候，如果晃动头部可能会导致眼压升高而引起头痛发作。反复出现头痛发作，建议及时到医院就诊，通过完善相关辅助检查明确病因并进一步治疗。