月经刚干净两天同房是否会怀孕，需要结合月经周期的判断，如果平时月经周期在28天到30天左右，月经结束2天属于安全期，性生活一般是不会怀孕的。

但如果月经周期不规律或是月经周期短，安全期和排卵期的时间也就会发生改变，月经结束2天性生活若没有避孕措施也就有意外怀孕几率，所以还需要根据自己的月经周期来推测。

建议用排卵试纸测试一下是否排卵期，若排卵试纸是阳性就说明是排卵期，怀孕几率是很大的，要及时的服用紧急避孕药补救。