肩关节损伤会影响肩关节的运动功能，包括肩关节的前屈、后伸、外展，以及环转功能。由于肩关节损伤可能会涉及到不同的组织结构，以及损伤的严重程度不同，对肩关节运动功能影响的程度也并不相同。

如果只是轻度的损伤，会表现为肩关节运动功能是存在的，但是会出现活动时的疼痛，从而限制了肩关节的运动功能。有些损伤就比较严重了，会出现相应的运动功能障碍，比如肩袖损伤，会出现肩关节外展功能的严重障碍，患者不能够抬举上臂。

另外，如果肩关节损伤涉及到了骨关节的损伤，造成相应的错位，会出现肩关节严重的功能障碍，各个方向的运动功能都会受到影响。