肾功能紊乱可见于多种原因，肾功能紊乱的原因可分为原发性和继发性。

原发性的因素最常见的是肾小球疾病，如慢性肾小球肾炎、急性肾小球肾炎、急进性肾小球肾炎等。也可见于肾小管间质疾病，如急性间质性肾炎、慢性间质性肾炎、肾盂肾炎等。

继发性因素常见的有免疫性疾病、代谢性疾病等。免疫性疾病包括系统性红斑狼疮、小血管炎、干燥综合征、结缔组织病等。代谢性疾病包括糖尿病、高尿酸血症等，均可导致肾功能的紊乱。另外，血管性疾病，如高血压、肾动脉狭窄等，也可导致肾功能紊乱。