上完厕所肛门火辣辣疼，大多是由于肛窦炎、肛管炎等疾病所致。肛窦炎和肛管炎患者在排便的过程中，由于粪便摩擦肛管皮肤以及感染的肛窦，就会导致肛门部刺痛，类似于火辣辣疼痛。可以使用复方角菜酸酯栓塞肛门，感染症状严重的也可以使用甲硝唑栓塞肛门缓解症状。

也可能是患者进食了辛辣的食物，而辛辣食物刺激肛管皮肤所产生火辣辣疼。一般改善饮食后症状就会缓解，需要清淡饮食，多吃蔬菜水果，多喝水，保持排便通畅。

另外，一些肛门部的其他疾病也可能导致类似的症状，比如肛裂。虽然肛裂引发的疼痛症状大多比较剧烈，但一些浅表的小裂口也可能导致肛门火辣辣的疼痛症状。