咽缩肌瘫痪症状是一侧麻痹常无症状，双侧麻痹症状明显。由于软腭麻痹，鼻咽不能闭合，患者说话出现开放性鼻音，进流质饮食时，容易逆流入鼻腔，并不能作吹哨或鼓气动作。

咽肌麻痹时，吞咽机能受到影响，病变之初，进流质有困难，而进固体食物无阻挡。但逐渐发展，食物停滞在喉咽部，有误入呼吸道的危险。检查可见软腭缺乏张力，发“啊”“啊”音时，软腭向健侧移动，患侧不能上举。

若两则麻痹，软腭松弛下垂，完全不能上抬，如同时有咽肌麻痹，则在梨状窝中可见唾液或食物潴留。