胃肠积液晚期可能会引起肠壁黏膜的缺血、坏死，出现水、电解质紊乱、酸碱失衡，由于梗阻导致胃肠积液，患者不能进食获得营养物质，因此会出现营养不良情况。

胃肠积液需要针对病因进行治疗，幽门梗阻和肠梗阻引起的胃液潴留和肠液潴留，应该及时的解除幽门梗阻和肠梗阻。

急性胃肠炎、胰腺炎、胆囊炎和阑尾炎都可引起胃肠液潴留，胃肠道积液是此类疾病的一种症状。原发性疾病治愈后，胃液或肠液潴留一般可以消失。