心房扑动和心房颤动都是由于心房的电生理传导通路发生的异常，而导致心房的搏动次数过快。二者在发病机制、病变程度、心电图改变以及并发症方面有很大差异。

心房扑动的频率大约在每分钟400次以内，而房颤的频率可达到每分钟450-600次。房扑和房颤都可以诱发心功不全，但房颤还能够导致右心房发生附壁血栓，血栓如果脱落还可以引起各种血栓性疾病。

心电图上房扑为规律发生的大F波，而房颤则出现极不规则的小F波，一定条件下房扑还可以转变成房颤。