脑膜炎预后同病原体及病情严重程度有关，通常病毒性脑膜炎预后较好，没有生命危险，这类病毒指呼吸道以及消化道的常见病毒。

单纯疱疹病毒性脑炎则病情危重，常可引起颞叶出血性改变，有时会因为颞叶出血诱发癫痫持续状态等，出现舌咬伤、窒息等严重并发症时可危及生命。化脓性脑膜炎及结核性脑膜炎因炎性分泌物沉积在颅底，常可引起脑积水，也可以引起颅内压增高，严重时可危及生命。

而新型隐球菌感染多见有免疫缺陷的患者，新型隐球菌引起中枢神经系统感染症，具有病情重、死亡率高的特点。