只有少数轻微的鹅口疮不需要进行治疗，大多数的鹅口疮都应积极地进行治疗，主要是以药物治疗为主。

可以在患儿每次吃奶前后用2%的碳酸氢钠溶液清洗口腔，然后将抗真菌药物，如制霉菌素片研磨成粉末，用生理盐水稀释后，涂抹在鹅口疮的部位。如果患儿为母乳喂养，在患儿吃完母乳以后，要及时地将乳房周围擦拭干净。如果为人工喂养，患儿所用的奶瓶、食具等应当使用沸水进行清洗，或者在弱碱性溶液中进行浸泡，并且隔离放置和使用。

如果是感染比较严重的鹅口疮，已经累及到了食道，应当给患儿服用一些抗真菌的药物进行治疗。经过有效的治疗，大多数小儿鹅口疮都能治愈。