脸颊长痘痘可能与遗传因素有关，由于受到遗传因素的影响，导致脸部皮肤的皮脂腺分泌，致使毛囊皮脂腺的导管发生角化，诱使痤疮丙酸杆菌大量繁殖，会造成脸颊长痘痘。

也可能与雄激素水平增高有关。进入青春期后，机体的雌激素与雄激素分泌水平不均衡，可造成皮脂腺增大。皮脂分泌会明显增加，致使痤疮丙酸杆菌大量繁殖，对毛囊导管部位的角质形成刺激，致使细胞过度角化和增殖，进而使皮脂的排泄受阻，在毛囊口部位过度堆积，久而久之会导致脸颊部位长痘痘。

还可能是由于没有注重对皮肤的清洁，导致细菌感染引起。